อิเซตัน ดำเนินธุรกิจห้างสรรพสินค้าในญี่ปุ่น ก่อตั้งปี พ.ศ. 2429 ในเขตชิโยดะ ผู้ก่อตั้งคือ Tanji Kosuge อิเซตันมีสาขาทั่วประเทศญี่ปุ่น และในภูมิภาคหลายประเทศ ส่วนในประเทศไทยเปิดบริการวันที่ 8 เมษายน พ.ศ. 2535 โดยบริหารงานโดย บริษัท อิเซตัน (ประเทศไทย) จำกัด
บริษัท อิเซตัน ประเทศไทย เป็นการร่วมทุนระหว่าง บริษัท อิเซตัน มิซูโกชิ จำกัด กับกลุ่มตระกูลโอสถานุเคราะห์ และตระกูลปัฐพาณิชย์โชติ
อิเซตันเปิดสาขาเดียวที่ศูนย์การค้า เวิลด์เทรด เซ็นเตอร์ ที่เดิมบริษัทวังเพชรบูรณ์ จำกัด ของตระกูลเตชะไพบูลย์ เป็นเจ้าของและผู้บริหาร ต่อมาได้เปลี่ยนเป็น เซ็นทรัล เวิล์ด จุดขายของอิเซตันคือ ร้านอาหารจากญี่ปุ่น และร้านหนังสือคิโนะคูนิยะ
อิเซตันประกาศหยุดกิจการสาขาในประเทศไทยวันที่ 31 สิงหาคม พ.ศ. 2563 เนื่องด้วยผลกระทบจากการแพร่ระบาดของโรคโควิด-19 และสิ้นสุดสัญญาเช่าพื้นที่ระหว่างอิเซตันกับเซ็นทรัลพัฒนา
การกลับมาอีกครั้งนี้ บริษัท isetan Mitsukoshi นำมาเฉพาะรูปแบบซูเปอร์มาร์เก็ตระดับไฮเอนด์ Mitsukoshi บนพื้นที่ 4,600 ตารางเมตร ในโครงการวัน แบงค็อก ถนนพระราม 4
สำหรับห้างสรรพสินค้าญี่ปุ่นที่เข้ามาเปิดสาขาในไทย และยุติกิจการไปแล้ว คือ ห้างสรรพสินค้าโตคิว และห้างสรรพสินค้าเยาฮัน